1)循環(huán)水沖式生態(tài)廁所總體上需設(shè)置膜組件處理單元，易受無機(jī)鹽類污染，操作要求較高，動力消耗大(電費(fèi)達(dá)5000余元)，減量化程度不高，   不   ，為減少臭味需定期及時(shí)排污和補(bǔ)充清水，存在著污染物累積趨勢，人數(shù)超載時(shí)生物處理效果較差。

2)免水打包型生態(tài)廁所清運(yùn)成木較高、勞動環(huán)境較差，在清運(yùn)過程中排泄物   有可能泄漏造成。次污染，且部分包裝材料不易降解。

3)免水微生物堆肥型生態(tài)廁所降解菌種單一，好氧型動力消耗大，厭氧型。次污染嚴(yán)重，減量化程度不高，需考慮肥料的出路。

4)目前，免水降解型生態(tài)廁所的問題是：使用的微生物原種還依賴于日本進(jìn)，成本高，約占每天200人次糞尿單蹲位主機(jī)價(jià)格的15%-20%；降解菌原種的篩選、馴化、、純化方面的關(guān)鍵技術(shù)的國產(chǎn)化還存在諸多難點(diǎn)，對產(chǎn)業(yè)化是一個(gè)制約因素；尿液比例大時(shí)要維持生物反應(yīng)器的正常運(yùn)行，還是一個(gè)難題。關(guān)于接待人次與降解效率、運(yùn)行溫度與、晝夜的管理、節(jié)假日與平時(shí)管理，均需   其內(nèi)在的規(guī)律和自動運(yùn)行方法，使運(yùn)行經(jīng)驗(yàn)提升為專家系統(tǒng)。

5)目前家庭使用的免水生態(tài)廁所還是空白。在技術(shù)上，目前任何一種生態(tài)廁所都不能   滿足家庭環(huán)境使用的要求，另外在觀念上生態(tài)廁所被家庭所接受也需要時(shí)日。